Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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Tmed6Q9CQG0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Tmed6Q9CQG0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Tmed6Q9CQG0 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed6Q9CQG0 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Tmed6Q9CQG0 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed6Q9CQG0 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed6Q9CQG0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed6Q9CQG0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed6Q9CQG0 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Tmed6Q9CQG0 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed6Q9CQG0 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed6Q9CQG0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed6Q9CQG0 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed6Q9CQG0 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Tmed6Q9CQG0 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed6Q9CQG0 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed6Q9CQG0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed6Q9CQG0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed6Q9CQG0 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed6Q9CQG0 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Tmed6Q9CQG0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Tmed6Q9CQG0 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed6Q9CQG0 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed6Q9CQG0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed6Q9CQG0 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed6Q9CQG0 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed6Q9CQG0 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed6Q9CQG0 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed6Q9CQG0 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed6Q9CQG0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed6Q9CQG0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed6Q9CQG0 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed6Q9CQG0 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed6Q9CQG0 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed6Q9CQG0 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed6Q9CQG0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed6Q9CQG0 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed6Q9CQG0 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed6Q9CQG0 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed6Q9CQG0 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed6Q9CQG0 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed6Q9CQG0 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed6Q9CQG0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed6Q9CQG0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed6Q9CQG0 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed6Q9CQG0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed6Q9CQG0 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms