Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms