Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Commd4Q9CQ02 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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