Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn6Q99PL6 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn6Q99PL6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn6Q99PL6 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn6Q99PL6 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn6Q99PL6 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn6Q99PL6 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn6Q99PL6 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn6Q99PL6 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn6Q99PL6 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn6Q99PL6 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn6Q99PL6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn6Q99PL6 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn6Q99PL6 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn6Q99PL6 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn6Q99PL6 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn6Q99PL6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn6Q99PL6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn6Q99PL6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn6Q99PL6 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn6Q99PL6 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn6Q99PL6 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn6Q99PL6 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn6Q99PL6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn6Q99PL6 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn6Q99PL6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn6Q99PL6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn6Q99PL6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn6Q99PL6 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn6Q99PL6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn6Q99PL6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn6Q99PL6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn6Q99PL6 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn6Q99PL6 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn6Q99PL6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn6Q99PL6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn6Q99PL6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn6Q99PL6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn6Q99PL6 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn6Q99PL6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn6Q99PL6 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn6Q99PL6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn6Q99PL6 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms