Protein–RNA interactions for Protein: Q99P51

Rassf3, Ras association domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf3Q99P51 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rassf3Q99P51 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms