Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms