Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncaipQ99ME3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncaipQ99ME3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SncaipQ99ME3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SncaipQ99ME3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SncaipQ99ME3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SncaipQ99ME3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncaipQ99ME3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SncaipQ99ME3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SncaipQ99ME3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncaipQ99ME3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncaipQ99ME3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncaipQ99ME3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncaipQ99ME3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncaipQ99ME3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncaipQ99ME3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncaipQ99ME3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncaipQ99ME3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncaipQ99ME3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncaipQ99ME3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncaipQ99ME3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SncaipQ99ME3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncaipQ99ME3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SncaipQ99ME3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SncaipQ99ME3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SncaipQ99ME3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SncaipQ99ME3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SncaipQ99ME3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SncaipQ99ME3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SncaipQ99ME3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SncaipQ99ME3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SncaipQ99ME3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SncaipQ99ME3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SncaipQ99ME3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SncaipQ99ME3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SncaipQ99ME3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SncaipQ99ME3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SncaipQ99ME3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SncaipQ99ME3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SncaipQ99ME3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SncaipQ99ME3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms