Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms