Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms