Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TriobpQ99KW3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms