Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lactb2Q99KR3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms