Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms