Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tspan1Q99J59 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tspan1Q99J59 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tspan1Q99J59 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tspan1Q99J59 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tspan1Q99J59 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tspan1Q99J59 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tspan1Q99J59 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tspan1Q99J59 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan1Q99J59 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan1Q99J59 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan1Q99J59 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan1Q99J59 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan1Q99J59 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan1Q99J59 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan1Q99J59 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan1Q99J59 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan1Q99J59 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan1Q99J59 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan1Q99J59 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan1Q99J59 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan1Q99J59 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan1Q99J59 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan1Q99J59 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan1Q99J59 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms