Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ctu1Q99J10 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ctu1Q99J10 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ctu1Q99J10 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ctu1Q99J10 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ctu1Q99J10 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ctu1Q99J10 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ctu1Q99J10 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ctu1Q99J10 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ctu1Q99J10 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ctu1Q99J10 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ctu1Q99J10 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ctu1Q99J10 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ctu1Q99J10 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ctu1Q99J10 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ctu1Q99J10 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ctu1Q99J10 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ctu1Q99J10 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms