Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms