Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Pde6cQ91ZQ1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Pde6cQ91ZQ1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Pde6cQ91ZQ1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Pde6cQ91ZQ1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Pde6cQ91ZQ1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Pde6cQ91ZQ1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms