Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD3

Tm4sf4, Transmembrane 4 L6 family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf4Q91XD3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm4sf4Q91XD3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm4sf4Q91XD3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm4sf4Q91XD3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm4sf4Q91XD3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm4sf4Q91XD3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm4sf4Q91XD3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm4sf4Q91XD3 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm4sf4Q91XD3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm4sf4Q91XD3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm4sf4Q91XD3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm4sf4Q91XD3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm4sf4Q91XD3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm4sf4Q91XD3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm4sf4Q91XD3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm4sf4Q91XD3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm4sf4Q91XD3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm4sf4Q91XD3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm4sf4Q91XD3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm4sf4Q91XD3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm4sf4Q91XD3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm4sf4Q91XD3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm4sf4Q91XD3 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm4sf4Q91XD3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm4sf4Q91XD3 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm4sf4Q91XD3 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm4sf4Q91XD3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm4sf4Q91XD3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm4sf4Q91XD3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm4sf4Q91XD3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm4sf4Q91XD3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm4sf4Q91XD3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm4sf4Q91XD3 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm4sf4Q91XD3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm4sf4Q91XD3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm4sf4Q91XD3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm4sf4Q91XD3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm4sf4Q91XD3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm4sf4Q91XD3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm4sf4Q91XD3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm4sf4Q91XD3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm4sf4Q91XD3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms