Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms