Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms