Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hps3Q91VB4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms