Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms