Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU3

Apol9a, Apol9a protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9aQ8VDU3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apol9aQ8VDU3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms