Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Rprd1aQ8VDS4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Rprd1aQ8VDS4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Rprd1aQ8VDS4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Rprd1aQ8VDS4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Rprd1aQ8VDS4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Rprd1aQ8VDS4 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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Rprd1aQ8VDS4 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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Rprd1aQ8VDS4 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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