Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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