Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms