Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc12Q8R344 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc12Q8R344 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms