Protein–RNA interactions for Protein: Q8K409

Polb, DNA polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolbQ8K409 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms