Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lin28aQ8K3Y3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lin28aQ8K3Y3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin28aQ8K3Y3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms