Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc12Q8K2L8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms