Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c1Q8K193 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms