Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LgsnQ8CIX8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms