Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc73Q8CDM4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms