Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc87Q8CDL9 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms