Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc159Q8C963 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc159Q8C963 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc159Q8C963 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc159Q8C963 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc159Q8C963 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc159Q8C963 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc159Q8C963 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc159Q8C963 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc159Q8C963 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc159Q8C963 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc159Q8C963 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc159Q8C963 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc159Q8C963 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc159Q8C963 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc159Q8C963 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc159Q8C963 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc159Q8C963 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc159Q8C963 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc159Q8C963 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc159Q8C963 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc159Q8C963 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc159Q8C963 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc159Q8C963 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc159Q8C963 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc159Q8C963 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc159Q8C963 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc159Q8C963 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc159Q8C963 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc159Q8C963 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc159Q8C963 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc159Q8C963 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc159Q8C963 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc159Q8C963 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc159Q8C963 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc159Q8C963 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc159Q8C963 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc159Q8C963 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc159Q8C963 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc159Q8C963 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc159Q8C963 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms