Protein–RNA interactions for Protein: Q8C735

Lin9, Protein lin-9 homolog, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin9Q8C735 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Lin9Q8C735 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Lin9Q8C735 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Lin9Q8C735 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Lin9Q8C735 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Lin9Q8C735 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Lin9Q8C735 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Lin9Q8C735 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Lin9Q8C735 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Lin9Q8C735 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin9Q8C735 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin9Q8C735 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin9Q8C735 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin9Q8C735 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin9Q8C735 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin9Q8C735 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin9Q8C735 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin9Q8C735 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin9Q8C735 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin9Q8C735 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin9Q8C735 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin9Q8C735 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin9Q8C735 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin9Q8C735 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms