Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnot2Q8C5L3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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