Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms