Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1C8

Pnma1, Paraneoplastic antigen Ma1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Pnma1Q8C1C8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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