Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Arl14ep-202ENSMUST00000093883 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm43104-201ENSMUST00000197234 311 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Tas2r142-ps5-201ENSMUST00000204651 929 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm18645-202ENSMUST00000212222 760 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Olfr1208-201ENSMUST00000099810 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Tmem156-201ENSMUST00000043352 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Tpt1-ps2-201ENSMUST00000120548 521 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm12583-201ENSMUST00000120677 853 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Bcas1os2-201ENSMUST00000131931 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm25971-201ENSMUST00000158953 286 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Vmn1r-ps19-201ENSMUST00000177008 926 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm5268-201ENSMUST00000189212 940 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm42794-201ENSMUST00000197636 835 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm3942-201ENSMUST00000218495 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 AC154742.1-201ENSMUST00000223477 573 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim35Q8C006 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms