Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx17Q8BVL3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms