Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR65

Suds3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3Q8BR65 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Suds3Q8BR65 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Suds3Q8BR65 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Suds3Q8BR65 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Suds3Q8BR65 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Suds3Q8BR65 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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