Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gtf3c4Q8BMQ2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gtf3c4Q8BMQ2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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