Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms