Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Nop53Q8BK35 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Nop53Q8BK35 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Nop53Q8BK35 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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