Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms