Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms