Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

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Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Usp8Q80U87 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Usp8Q80U87 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Usp8Q80U87 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Usp8Q80U87 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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