Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPD1

Fbxo11, F-box only protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 930 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo11Q7TPD1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbxo11Q7TPD1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxo11Q7TPD1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms