Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms