Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nphp3Q7TNH6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms